泌尿系統結石是由尿液中的草酸鹽、磷酸直、尿酸鹽、碳酸鹽、胱氨酸等成分滲出，凝結成結晶而形成的。攝護腺肥大症患者由於排尿不暢，尿液在膀胱內積聚，會導致尿液不能及時排出，尿液濃縮，尿液中的成分沉淀結晶，進而形成膀胱結石。如果排尿困難更加嚴重，會使腎盂內尿液排出緩慢，而引起腎結石或輸尿管結石。
膀胱結石的發生主要與攝護腺肥大症導致的尿液瀦留有關，膀胱內尿液瀦留，濃縮的尿液中的小晶體及其他小顆粒都會在膀胱內積聚，膀胱炎症的刺激也會引起尿液內物質發生沉淀，由於這些顆粒不能隨尿液及時排出體外，就逐漸融合增大，進而形成結石。攝護腺肥大症症並發的膀胱結石一般都是圓形或橢圓形，其成分大多為尿酸或尿酸銨，還可以含有磷酸鎂銨。排尿時結石會對尿道內口造成不同程度的創傷並產生排尿中斷的症。但如果攝護腺明顯突入膀胱， 在病人站立時結石往往處於攝護腺周圍相對較低的位置，而不能堵塞尿道內口，這樣就不一定會出現排尿中斷的現象。
嚴重的攝護腺肥大症會引起嚴重排尿不暢，尿液在腎盂、輸尿管中的流動速度較慢，甚至可能出現尿液逆流，可能導致腎結石和輸尿管結石的產生，嚴重者引起腎絞痛。
