由於外科手術治療對人體具有較大的創傷，因此不能成為攝護腺疾病治療的常規方法。隻有對那些長期采用常規治療手段不能或難以控制，而臨床症狀又十分嚴重的慢性攝護腺發炎患者，尤其是同時合並攝護腺結石、攝護腺膿腫、嚴重影響排尿的梗阻型攝護腺肥大症、攝護腺癌或可能轉變成攝護腺腫瘤、嚴重的攝護腺結核、嚴重的攝護腺疼痛等患者，在萬不得已的情況下才考慮進行外科手術治療。
主要有以下幾種因素：
一、絕大多數慢性攝護腺發炎患者經過積極有效的非手術治療，都能夠獲得比較滿意的效果。
二、手術治療可能給患者帶來比較嚴重的後果，例如性功能和生殖功能的部分或完全喪失等。
三、由於長期的炎症刺激，攝護腺與周圍組織容易發生粘連，術中容易出血且不容易摘除幹凈，手術時還容易損傷領近組織器官而引起並發症，所以慢性攝護腺發炎手術比較困難。4要進行攝護腺的手術治療還需要有一定的設備和技術力量。最重要的是手術並不能解決所有患者的問題，很多手術治療後的患者，臨床症狀依然存在。
攝護腺發炎手術後麻煩不斷
慢性攝護腺發炎一般為局灶性或節段部分性，攝護腺液檢查不能充分反映攝護腺發炎的嚴重程度，因而不能作為手術依據。對於有精神症狀的慢性攝護腺發炎患者，更應視為手術禁忌證。
外科手術治療方法包括對攝護腺膿腫的引流、切除膀胱頸部、攝護腺完全或部分切除、攝護腺精囊全切除術、攝護腺及其結石的摘除、精囊切除術、經尿道逆行氣球擴張術等。對於包皮過長或包莖患者，可以在攝護腺發炎治療好後施行包皮環切術，以減少包皮龜頭內存在的大量微生物對攝護腺的可能感染機會。有學者認為包皮環切術應該在治療攝護腺發炎之前進行，並已經在實踐中獲得了良好的效果。
一些患者在手術切除具有炎症的攝護腺後，例如經尿道電切攝護腺切除術後，攝護腺周圍仍然有含有大量感染灶和結石。
由於病原體可能仍然在攝護腺區域存在或由於手術導致擴散，使手術切除攝護腺後也不能完全消除患者的症狀，患者仍然可有尿頻、尿急、尿痛、夜尿、會陰部不適或疼痛，甚至出現畏寒、發熱等慢性攝護腺發炎或急性攝護腺發炎樣的症狀，所以手術治療有時也很難達到完全徹底治療好的目的。顯然，手術適應證的選擇就要更加慎重。
手術治療，利弊參半
由於手術治療對人體具有較大的創傷，因此不能成為攝護腺發炎治療的常規方法。
隻有對那些長期采用常規治療手段不能或難以控制，而臨床症狀又十分嚴重的慢性攝護腺發炎患者，尤其是同時合並攝護腺結石、攝護腺膿腫、嚴重影響排尿的梗阻型攝護腺肥大症、攝護腺癌或可能轉變成攝護腺腫瘤、嚴重的攝護腺結核、嚴重的攝護腺疼痛等患者，攝護腺發炎在萬不得已的情況下才考慮進行手術治療。
西醫治療攝護腺肥大症，主要用手術方法切除腺體肥大症部分，以解除尿路梗阻。手術治療法適用於攝護腺肥大症II度以上，分期為III期者。
一般正常攝護腺為栗子大小，I度增大約為鴿蛋大，II度約為雞蛋大，III度約為鴨蛋大，再大為IV度，這個分法目前被臨床醫生所普遍采用。
臨床分期則是根據症狀的輕重確定的。I期排尿困難、多尿、尿線無力、膀胱逼尿肌出現代償性肥厚，但無尿液瀦留。II期膀胱開始失代償，出現尿液瀦留，常發生細菌性膀胱炎。III期膀胱長時間失代償，尿液瀦留嚴重，出現腎功不全。
當攝護腺增大為Ⅲ度，或分期達Ⅲ期時，保守治療多無效。西醫則主張及早手術，手術的優點是切除攝護腺肥大症部分，解除尿路梗阻，見效快。缺點是並發症多，有些並發症後果嚴重，此外手術後亦可復發，同時開刀之苦也為許多高齡病人所顧慮，故病人難以接受。
手術早期並發症，多發生在48小時以內，如休克、急性腎功衰竭、出血，這與手術及麻醉有關。晚期並發症，發生於48小時以後的康復過程中，因采取術式不同，常見的並發症有：
（1）尿路感染。
（2）繼發附睪炎、精囊炎、攝護腺發炎。
（3）尿瘺。繼發於切口感染及下尿路梗阻。
（4）排尿困難。因術中處理不當，操作粗暴及感染，導致尿道狹窄、膀胱頸狹窄所致。
（5）尿失禁。手術損傷尿道外括約肌或膀胱頸攝護腺周圍平滑肌所致。
（6）尿道直腸瘺。術中損傷直腸壁引起。
（7）性功能障礙。無論采取何種手術方式，都能不同程度地損傷控制陰莖勃起神經，以致出現陽痿
攝護腺肥大症用藥禁忌
攝護腺肥大症的早期症狀是尿頻和夜尿增多，隨著病情的加重，可逐漸發展成為尿瀦留。有不少藥物會引起和加重尿瀦留，且反應迅速，一般在用藥後2～4小時內即可發生。
抗精神病藥如氯丙嗪、奮乃靜、氟哌啶醇、氯氮平等，可引起排尿困難。
抗抑鬱藥如丙咪嗪（米帕明）、多塞平、阿米替林、氯丙咪嗪等，會引起尿瀦留。
平喘藥如氨茶堿、茶堿、麻黃素、異丙喘寧（奧西那林）等，均可導致排尿困難。
心血管藥如心得安（普萘洛爾）、心痛定（硝苯地平）以及異搏定（維拉帕米）等，皆會抑制膀胱肌的收縮而發生尿瀦留。
解痙藥胃腸道止痛藥如顛茄、阿托品、東莨菪堿、山莨菪堿（654-2）、胃瘍平、安胃靈（奧芬溴銨）、普魯本辛（丙胺太林）等，均會使膀胱肌松弛，而造成無法排尿。
強效利尿藥強效利尿藥如速尿、利尿酸等，可使電解質失去平衡，進而導致尿瀦留。故有攝護腺肥大症的患者須改用中效利尿藥，如雙氫克尿噻等，或低效利尿藥，如安體舒通等進行治療。
抗過敏藥如非那根（異丙嗪）、暈海寧（乘暈寧）、苯噻啶、撲爾敏以及阿紮他定、美喹他嗪等，均會增加排尿困難，可改用息斯敏（阿斯咪唑）治療。
外用藥阿托品滴眼液和麻黃素滴鼻液也應慎用。
其他藥安定類藥物、異煙肼、美加明、維腦路通（曲克蘆丁）及中藥華山參、枳實等，均可導致尿瀦留。目前常用的抗感冒藥如克感敏、感冒通、感冒靈、感冒清、速效傷風膠囊等，因含有撲爾敏，也應慎用。
