攝護腺發炎和精囊炎都是臨床上較為常見的男性泌尿系疾病，然而，由於二者的發病機理十分相似，因此臨床上比較不容易分別，也有很多患者幹脆就把它們統稱為攝護腺精囊炎，事實上，指出這個概念是錯誤的。
關系一、兩者的慢性過程很難鑒別
據統計經輸精管與精囊造影發現87.5%的慢性細菌性攝護腺發炎患者均有不同程度的病理改變。在慢性病程中，兩者常互相存在，相互影響。所以，兩者的慢性過程很難鑒別。
關系二、感染途徑都經由尿道
精囊炎感染來源細菌經尿道，射精管上行蔓延至精囊所致。攝護腺發炎的感染途徑為經尿道直接蔓延：細菌經尿道口上行進入尿道，再經攝護腺導管侵入攝護腺體，引起急性或者慢性攝護腺發炎。
關系三、發病率不同，臨床檢查方式不同
精囊炎與攝護腺發炎的區別主要表現在發病率上以攝護腺發炎較高，而精囊炎較低。在臨床症狀上表現為，攝護腺發炎具有攝護腺相關的症狀，而精囊炎以血精為主；在化驗檢查上，攝護腺發炎具有攝護腺液的異常改變或存在病原體，而精囊炎具有精囊液異常或存在病原體，並可以通過檢驗精液而間接了解。
關系四、生理結構上，位置相近
精囊是儲存精子的場所，位於膀胱底部與直腸之間，在醫生按摩攝護腺時，在攝護腺兩側上外方，就可以觸摸到葡萄大小的囊狀物，既為精囊。精囊的排洩管與輸精管末端會合成射精管，穿過攝護腺進入尿道。
