性交造成生殖器損傷的情況是較少見的，即使發生也多因生殖器存在潛在的異常。但話又說回來了，性傳播疾病的發生多與生殖器損傷有關，因為損傷才使病原微生物得以進入患者體內，當然這種損傷是輕微的，往往是肉眼難以發現的。我們這裡談的可都是非常明顯的損傷。
1、尿道──激烈的性交往往使某些男子發生尿道炎，特別是患者具有包莖、個人衛生差、或女方有陰道炎時。尿道會有觸痛，有時有尿痛，通過顯微鏡檢查和培養可以作出診斷和鑒別其病因。
2、尿道損傷──長時間的激烈的性交或對尿道施加壓力過大的女對男口交可以引起尿道創傷和伴發的疼痛。由於尿道海綿體在勃起時充血變硬，所以容易受到損傷。在陰莖根部使用負壓吸引裝置或理療環等性器具以增進或延長勃起時可能損傷尿道。事先早已存在的尿道炎、尿道結石、尿道憩室、尿道狹窄等異常均可增加尿道損傷的可能性。
3、陰莖皮膚創──常見於咬傷，潛在的包皮異常和使用性工具。尤其是器具的使用可使遠端出現水腫後往往難於或無法取下器具。除非拖延過久出現壞死，大多數可以完全恢復。有時因尿道水腫嚴重引起排尿困難，可能需要使用2號導尿管或行恥骨上膀胱造口術。
4、包皮嵌──發生於包皮過長過緊的男子，當包皮後退到龜頭後的冠狀溝時，由於龜頭充血和包皮水腫，包皮無法回到原來位置。這時應限制對龜頭的血液供應，因此需要立即去醫院處理這一問題。
5、睪丸損──一般來講，睪丸白膜可以承受50千克的力而不破裂，加上它的可移動性和位置深在，所以性交時造成睪丸損傷的機會是少見的。如果真的出現損傷，很可能是睪丸被擠到恥骨或腹股溝區域。如果懷疑睪丸出血或白膜破裂，應去醫院進行外科手術探查和修補。通常可以保存其生精功能和激素分泌功能。根據病史和睪丸觸痛，或存在表面的破裂，診斷不應困難。先前若存在附睪炎或鞘膜積液均會因睪丸在性交中的活動而造成性交不適。
6、陰莖異常勃──很少發生於性交時間過久和動作過於劇烈的情況下。果然出現這一病症時應該進行血象檢查以除外鐮狀細胞貧血和白血病等。還應追問有無神經疾患史、創傷史、特殊藥物史。
7、陰莖折──它通常是一根或兩根陰莖海綿體白膜撕裂造成的，它隻有在陰莖勃起時才會發生。勃起時白膜變薄，隻有1/4－1/2毫米厚。撕裂多發生在陰莖的中段和遠端。病人會報告在損傷發生時聽到咔喳一聲響，然後是劇痛和迅速腫脹。腫脹、變色和變形是臨床常見的體征。伴有尿道損傷的可占30％。當尿道口流血、尿血或排尿困難時應懷疑有尿道損傷。性交決不是唯一的也不是常見的引起陰莖損傷的原因。大多數發生於用力擠捏陰莖以減少陰莖勃起時，或以勃起的陰莖在床上或硬物上摩擦時；也可發生在勃起陰莖受到踢、打、跌等創傷時；性交時發生陰莖折斷多於勃起陰莖撞在女方恥骨、會陰、抽動時脫出撞在床板上、或急劇改變性交體位時。
