攝護腺肥大症症最為嚴重的並發症是慢性腎功能不全，這是由於攝護腺肥大症所造成的膀胱內高壓導致膀胱輸尿管反流，影響到輸尿管、腎臟，引起這兩個器官的積水，並最終使腎功能受到破壞，導致慢性腎功能不全。此時，病人如仍得不到及時治療，就會發展為尿毒症，危及生命。
早期攝護腺肥大症引起的排尿困難並不會影響腎臟的結構，或導致腎臟功能下降。隨著攝護腺肥大症的進展，尿道狹窄加重，尿液排出困難，而導致尿液積聚在膀胱，膀胱內殘餘尿液增加。尿液在膀胱內的瀦留可導致膀胱內壓增高，腎盂及輸尿管內的尿液不能通暢地流入膀胱，繼而排出體外。久而久之，輸尿管和腎盂會出現輕度的擴張，這時並沒有影響到腎實質，腎功能一般不出現異常。
如果這種病理狀態不能得到及時的改善，腎盂擴張逐漸加劇，最終會形成腎盂積水。腎盂積水早期患者不會有任何症狀，晚期患者可能出現患側腰部脹痛的感覺，腎盂積水較嚴重時，腎實質受到擠壓，會發生萎縮，腎臟功能下降，出現腎功能不全，最終發展成為尿毒症。
