在臨床上攝護腺結石主要是依據服部平片以及直腸指診的方法來確診的，經直腸可觸及攝護腺表面有多發性結節，並有結石的摩擦感，x線檢查可以了解結石的數目、大小以及位置所在。對無症狀和未繼發其他疾病的攝護腺結石一般不需特殊處理。大的或多個結石可根據病人年齡及身體狀況考慮手術治療的可能性，一般藥物對它們是無效的。
小的攝護腺結石可引起慢性炎症，有炎細胞浸潤，腺泡內充滿碎屑和脫落上皮，因而可擴張，腺腔的大小和形狀可改變，其上皮襯裡消失。腺泡間也有炎細胞浸潤及纖維化，結石周圍的攝護腺基質亦纖維化。
較大的結石會引起整個腺管的堵塞，僅剩留少量的腺體組織。伴有炎症及化膿時，可引起攝護腺周圍炎。嚴重感染時可形成膿腫，甚至穿破形成瘺管。因此，攝護腺結石常伴發反復尿路感染，結石是繼發性尿路感染的根源。
