研究發現，長期以來，由於對攝護腺發炎的原因研究不夠深入，造成對攝護腺發炎的治療，隻是單純的停留在對炎症的消除上，而忽視了對於攝護腺自身免疫功能的修復，導致在攝護腺發炎的治療上出現了反復發作的治療弊端。
急性期，可采用抗生素，主要包括喹諾酮類、磺胺類、大環內酯類及四環素類抗生素。最好采用胃腸道外的靜脈給藥途徑，在未明確致病菌種類之前，可給予青黴素，鏈黴素，氨基糖苷類等廣譜抗生素。一般急性期抗生素的應用寧長勿短，建議為4~6周。
除了使用抗生素，還可選用抗炎藥治療慢性攝護腺發炎，其療效可靠，是短期2線合理治療的選擇，無論是短作用時間的非甾體類抗炎藥或是環氧合酶-2抑制劑，在改善慢性攝護腺發炎症狀中越來越顯示其優勢，且不良反應輕。
藥物治療上還可使用鎮痛藥、α-受體阻滯劑等。另外還可綜合心理精神治療、飲食治療進行綜合治療。
急性攝護腺發炎的用藥指南
在臨床上80%的攝護腺發炎同時伴發精囊炎而出現血精，要鑒別攝護腺發炎或精囊炎是很困難的，幾乎所有的攝護腺發炎和精囊炎都有後尿道炎，而約有40%左右的後尿道炎伴發有攝護腺發炎。因此在急性攝護腺發炎或急性精囊炎的抗炎治療抗菌藥的選用上也沒必要分開考慮。
急性攝護腺發炎或急性精囊炎出現血精的治療問題，除一般的處理外，抗菌治療是非常重要的，無需止血治療。但由於攝護腺體表面有一層脂質類的包膜，許多抗生素很難通過此膜而滲透到腺體內而達到治療作用。
攝護腺發炎吃什麼藥，要遵循以下原則：
①要根據藥敏選用。
②選擇高脂溶性、高滲透性、與血漿中蛋白結合率低、離解度大的抗菌藥物。
③聯合用藥，劑量要足，療程要長。用藥要4周以上。
攝護腺發炎吃什麼藥好呢？醫師指出：攝護腺發炎吃什麼藥都不如從飲食中吃到營養最重要，對於攝護腺發炎患者來說，多食新鮮水果、蔬菜、粗糧及大豆制品，多食蜂蜜以保持大便通暢，適量食用牛肉、雞蛋；不能因尿頻而減少飲水量，多飲水可稀釋尿液；禁飲烈酒，少食辛辣肥甘之品。這些都對治療攝護腺發炎有好處。
除了接受正規治療以外，攝護腺發炎的治療過程中還需要配合以健康的生活習慣和飲食習慣。
攝護腺發炎重在預防，預防又於食物最為重要，病從口入，健康也是從口入。攝護腺發炎患者在平常生活中，應該注意以下幾點：
1、注意飲食結構、營養均衡，及勞逸結合。醫師指出日常飲食可以輔助治療攝護腺發炎。
2、注意不能久坐、熬夜、酗酒。
3、樹立良好的心態，一旦患病切不可亂投醫。
4、性生活應規律，節制，但如夫妻長久分居也不利於攝護腺康復，且易復發
5、忌食煙酒、辣椒、大蒜、芹菜、蘿卜等食物。
