正規醫院在診斷攝護腺發炎時主要有三個步驟，先是醫生仔細詢問患者症狀，然後查攝護腺液，最後化驗尿常規。醫生會根據兩項檢驗結果來判斷是不是攝護腺發炎。然而，不少醫院都存在著攝護腺發炎診斷不規范的問題。這主要有兩方面：首先，醫院不重視鑒別診斷。
攝護腺發炎主要表現為排尿異常，但引起排尿異常的疾病有很多，包括尿道狹窄、泌尿系統結核等。不注意鑒別診斷，就容易把上述疾病誤診為攝護腺發炎。其次，有些診斷方法不規范。部分醫院在診斷慢性非細菌性攝護腺發炎時，會采用尿道塗片和PCR 檢查。
實際上，對於沒有尿道分泌物的患者，尿道塗片沒有意義。所謂PCR 檢查，是分子測試的一種，主要用於檢測病原菌。但PCR 檢查常會有“假陽性”的結果，誤診率很高。同時，一些不太正規的醫院因為操作消毒上不嚴格，也會造成檢測結果呈假陽性。
合理治療攝護腺發炎，必須先明確疾病分類和病程發展，根據不同類型采取相應的治療手段，注意生活調節，做到“養治並舉”。治療上，醫生應合理使用抗生素，以4～6 周為1 個周期。同時，輔以α受體阻斷劑、抗炎止痛藥物、植物提取藥物、肌肉松弛藥物等。
在生活上，要鼓勵病人樹立信心，養成良好生活習慣，這對治療攝護腺發炎和鞏固療效有很大作用。此外，每天溫水泡澡、戒煙酒、忌食辛辣刺激食物、不要長時間騎車和久坐、性生活有規律、注意保暖、鍛煉身體、增強機體免疫力等，都有利於治療攝護腺發炎。
患者應該明白，攝護腺發炎並不是難以治療的頑疾，只要持之以恒，配合醫生，就能得到有效控制並治療好。
