由於兩類陽痿的治療方法不同，治療效果也不一樣，因此區別功能性陽痿和器質性陽痿十分必要。
1、從起病緩急看，功能性陽痿一般起病突然，進展迅速，而器質性陽痿通常都是逐漸起病，進展緩慢。
2、從發病原因方面看，功能性陽痿與精神因素關系密切，如恐懼、抑鬱、焦慮、精神創傷、內疚、夫妻感情不和、性知識缺乏、自慰過度等。器質性陽痿多與性器官解剖上的異常、外傷、藥物中毒、某些慢性疾病等有關。
3、從夜間至清晨初醒的陰莖勃起情況看，功能性陽痿陰莖勃起堅硬，器質性陽痿未有勃起或勃起不堅。
4、在性刺激下，功能性陽痿陰莖勃起，但企圖性交時勃起消失，器質性陽痿勃起減弱或消失，對性刺激缺乏反應。
5、陰莖海綿體血管活性物質注射試驗，功能性陽痿在8分鐘至10分鐘內一般能充分勃起，而且堅硬，而器質性陽痿（神經性陽痿例外）在8分鐘至10分鐘內勃起不滿意。
功能性陽痿多通過心理、藥物治療，預後較好，而器質性陽痿多用器械、手術治療，近期及遠期療效不滿意。
